叶子区别：山茱萸叶子呈纸质。卵状披针形。全缘；吴茱萸叶子呈卵形或椭圆形。叶子上长有绒毛。花朵区别：山茱萸花朵黄色。花瓣4枚。呈舌状披针形；吴茱萸花序顶生。花瓣有5枚。果实区别：山茱萸核果长圆形。红色或紫红色；吴茱萸果实暗紫红色。有油点。
一、叶子区别
山茱萸叶子对生。呈纸质。叶片的形状呈卵状披针形或卵状椭圆形。长5.5到10厘米。宽2.5到4.5厘米。叶子的先端逐渐变尖。基部呈宽楔形或接近圆形。叶子全缘。上面绿色。下面浅绿色。
吴茱萸叶子有5到11小片。小叶薄或是呈厚纸质。叶片呈卵形、椭圆形或是披针形。长6到18厘米。宽3到7厘米。叶子全缘或接近浅波浪状。小叶的两面以及叶轴长有绒毛。
二、花朵区别
山茱萸伞形花序生长在枝侧。花瓣有4枚。呈舌状披针形。长3.3毫米。呈黄色。
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叶子区别：树番茄叶子互生，呈卵形或卵状心形；番茄羽状复叶或羽状深裂。花朵区别：树番茄聚伞式花序近腋生，花冠辐状，粉红色；番茄花朵黄色，花冠辐状。果实区别：树番茄果实卵状，表面光滑，桔黄色或带红色；番茄浆果扁球形或近球形，桔黄色或向红色。
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吴茱萸花序顶生。花朵的萼片以及花瓣都是5枚。花瓣长3到5毫米。花瓣的腹面长有绒毛。
三、果实区别
山茱萸核果长椭圆形。颜色呈红色或紫红色。长1.2到1.7厘米。直径5到7毫米。
吴茱萸果序宽3到12厘米。果实成熟时暗紫红色。有油点。
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